Phân lập và đánh giá đa dạng di truyền của một số chủng giống vi khuẩn nội sinh trong cây khoai tây bằng chỉ thị RAPD và ISSR

Abstract

This study successfully isolated and investigated the effects of inoculation of 35 endophytic bacteria isolated from potato roots on the germination of Brassica integrifolia, from which 14 isolates were selected for genetic diversity analysis with 15 RAPD and 13 ISSR markers. The two groups of markers have amplified a total of 323 loci, in which the average rate of polymorphic loci reached 97.98% for the RAPD marker and 98.56% for the ISSR marker. 28 markers amplified 1.969 PCR products. The 14 isolated isolates had genetic diversity ranging from 0.34 - 0.96. At the genetic similarity coefficient of 0.57, the 14 microbial varieties were grouped into 3 main groups. It is concluded that the genetic diversity of the 14 isolated isolates is very high. The evaluated isolates can be used to study the effects of the inoculation on the performance of potato plants under in vitro conditions as well as in greenhouses or in the field.

Tóm tắt

Đã phân lập và khảo sát ảnh hưởng của việc lây nhiễm 35 chủng giống vi sinh vật nội sinh phân lập từ rễ cây khoai tây lên sự nảy mầm của hạt rau cải, từ đó lựa chọn được 14 chủng giống vi sinh vật phục vụ phân tích sự đa dạng di truyền với 15 chỉ thị RAPD và 13 ISSR. Hai nhóm chỉ thị đã nhân bản được tổng số 323 locus, trong đó tỷ lệ các locus đa hình trung bình đạt 97,98% đối với chỉ thị RAPD và 98,56% đối với chỉ thị ISSR. 28 chỉ thị đã nhân bản được 1.969 sản phẩm PCR. 14 chủng giống vi sinh vật phân lập được có sự đa dạng di truyền dao động từ 0,34 - 0,96. Tại giá trị trung bình của hệ số tương đồng di truyền là 0,57; 14 chủng giống vi sinh vật có thể được phân thành 3 nhóm chính. Như vậy, sự đa dạng di truyền của 14 chủng giống vi sinh vật phân lập được là rất cao. Các chủng giống vi khuẩn có thể được sử dụng cho các nghiên cứu thử nghiệm trên cây khoai tây trong điều kiện in vitro cũng như ngoài nhà lưới hoặc đồng ruộng.