ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÁC MẪU GIỐNG XOÀI TẠI TRUNG BỘ VÀ NAM BỘ VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ SCOT

Abstract

Thirty mango cultivars collected in Central and Southern Vietnam were evaluated genetic diversity using the Start Codon Target (SCoT) marker. Twenty-two out of 46 primers were chosen as high polymorphism markers. The analysis of 22 markers SCoTored 336 DNA bands which were all polymorphism with average bands varied from 10 to 22 bands. The UPGMA clustering method divided 30 mango cultivars into 2 main groups, group I included taxa which had export value while group II mostly consisted of local mango cultivars. Even in the same varieties, original ortets were not completely similar in heritability. These results provided useful method for management of orginal elite trees.

Tóm tắt

Nghiên cứu được thực hiện với vật liệu nghiên cứu chính gồm 30 mẫu giống xoài thu thập tại các tỉnh/thành miền Trung và miền Nam Việt Nam và hệ thống chỉ thị SCoT gồm 52 mồi. Kết quả khuếch đại cho thấy, trong tổng số 52 mồi được khuếch đại, ghi nhận được 22 mồi SCoT cho kết quả đa hình với tổng số 336 band đạt tỷ lệ 100% đa hình. Các band đa hình của các mồi này dao động từ 10 đến 22 band, trong đó SCoT05 và SCoT06 là hai mồi cho số band đa hình lớn nhất (22 band); SCoT17 là mồi cho số band đa hình thấp nhất (10 band). Nghiên cứu sử dụng phương pháp phân nhóm UPGMA chia tổng số 30 mẫu giống xoài này thành hai nhóm chính, trong đó nhóm I bao gồm chủ yếu các giống xoài cát Hòa Lộc có giá trị kinh tế cao; nhóm II đa số các giống bản địa. Dù các mẫu giống đều thuộc cùng một loài, nhưng nếu nguồn gốc của chúng thuộc các cây đầu dòng khác nhau thì sẽ cho kết quả phân tích di truyền khác nhau, đây được xem là cơ sở để xây dựng một hệ thống nhằm quản lý tốt các cây ưu thế của loài.