ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG CAM ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM BẰNG CHỊ THỈ SSR

Abstract

DNA fingerprinting of 36 local orange (Citrus sinensis L. Osbeck) varieties was investigated by 30 SSR markers. The results revealed that the total number of alleles detected in 30 loci was 95 with an average of 3.17 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC) values varied from 0,31 (Ci07B09) to 0.84 (AG14) with an average of 0.58 and genetic similarity coefficient from 0.59 to 0.81. At a genetic similarity coefficient of 0.55, orange varieties were divided into two groups: group I consisted of 28 orange varieties with genetic similarity coefficient ranging from 0.598 to 0.81; group II consisted of 8 orange varieties with genetic similarity coefficient ranging from 0.61 to 0.716. The research revealed 5 loci have unique alleles consisted of CT02, mCrCiR01D06a, CiBE0246, CiBE0105, CiBE2165. The results are useful and handy for management of orange germplasm, orange variety identification and breeding programs.

Tóm tắt

Nghiên cứu thiết lập tiêu bản ADN của tập đoàn 36 giống cam địa phương, sử dụng 30 chỉ thị SSR để nghiên cứu đa hình giữa các giống cam. Kết quả cho thấy tổng số alen phát hiện tại 30 locut là 95 alen khác nhau, trung bình 3,17 alen/locut. Hệ số thông tin đa hình của mồi (PIC) dao động từ 0,31 (Ci07B09) đến 0,84 (AG14), trung bình 0,58 và mức độ tương đồng di truyền trong khoảng từ 0,59 đến 0,81. Tại mức tương đồng di truyền 0,59, các giống cam nghiên cứu chia làm 2 nhóm: nhóm I gồm 28 giống có mức tương đồng di truyền từ 0,598 đến 0,81; nhóm II gồm 8 giống có mức tương đồng di truyền từ 0,61 đến 0,716. Nghiên cứu đã xác định được 5 chỉ thị cho nhận dạng đặc trưng CT02, mCrCiR01D06a, CiBE0246, CiBE0105, CiBE2165. Các kết quả thu được có ý nghĩa trong công tác nhận dạng giống phục vụ công tác bảo tồn cũng như chọn lọc giống cam ở Việt Nam.