TẠO KHÁNG THỂ ĐA DÒNG NHẬN BIẾT PROTEIN P9 CỦA VI RÚT LÙN SỌC ĐEN PHƯƠNG NAM BẰNG ĐOẠN PEPTIDE TỔNG HỢP

Abstract

Southern rice black-striked dwarf virus (SRBSDV) caused serious rice losses in an area of millions of hectares throughout Southern China, Northern and Central Vietnam in the period 2009-2011. In 2017, the disease showed signs of recurrence in Thai Binh and some rice growing areas in the North. Genome of SRBSDV contains 10 segments of double-stranded RNA named S1 to S10 according to their size from 1.8 to 4.5 kb. While S9 segments is 1899 bp that participates in creating viroplasm structure, plays a role in the process of replication and assembly of virus molecules in host cells. In this study, we produce antibodies against SRBSDV from small antigenic peptide derived from the SRBSDV P9 protein. The purified antibody showed a titer of 1:50.000 and could specifically recognize SRBSDV in SRBSDV-infected rice samples in Dot-ELISA assay.

Tóm tắt

Bệnh lúa lùn sọc đen do vi rút lùn sọc đen phương Nam (Southern rice black-striked dwarf virus-SRBSDV) đã gây dịch bệnh nghiêm trọng trên lúa với diện tích hàng triệu hecta tại các vùng trồng lúa ở phía Nam Trung Quốc và miền Bắc và Trung Việt Nam trong giai đoạn 2009-2011. Năm 2017, bệnh có dấu hiệu tái phát tại Thái Bình và một số vùng trồng lúa khu vực phía Bắc. Hệ gen của SRBSDV có chiều dài 29124 bp, gồm 10 phân đoạn RNA sợi đôi, có kích thước từ 1,8 đến 4,5 kb, được đánh số từ S1 đến S10. Trong đó, phân đoạn S9 có chiều dài 1899 bp tham gia tạo cấu trúc viroplasm, có vai trò trong quá trình tái sinh và lắp ráp phân tử virus trong tế bào ký chủ. Trong nghiên cứu này, đã xác định những đoạn peptide có kích thước nhỏ trên P9 vừa có tính bảo thủ cao với các mẫu SRBSDV của Việt Nam đã được giải trình tự vừa có tính kháng nguyên cao, đoạn peptide sau đó được sử dụng để tạo kháng thể. Kháng thể tinh sạch có hiệu giá 1:50.000, có thể phát hiện đặc hiệu sự có mặt của đoạn peptide có nguồn gốc từ protein P9 và SRBSDV trong các mẫu lúa nhiễm bệnh lùn sọc đen bằng kỹ thuật Dot-ELISA.