ĐỊNH DANH VI KHUẨN GÂY BỆNH THỐI NHŨN TRÊN KHOAI MÔN Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG

Abstract

The research was carried out in Laboratory of Plant Protection Department, Can Tho University. The objective of this research was to identify the bacterial species causing bacterial soft rot disease on Taro in Mekong delta. In this study, the samples were determined based on morphological, biochemical and pathogenicity. The results showed that all 8 strains belonged to genus Erwinia and was divived two groups: group 1 inculded 4 strains (ErĐT2, ErĐT3, ErĐT4 and ErĐT5) which were characteristics of Erwinia carotovora and group 2 inculded 4 strains (ErAG1, ErAG2, ErĐT1 and ErĐT6) which were characteristics of Erwinia chrysanthemi. They induced typical symptoms of soft rot disease on Taro. The nucleotide sequences of 16S rDNA were determined and compared with the 16S rDNA sequences existing on Genebank. The results indicated that the nucleotide sequence of ErĐT4 (belonged to group 1) showed 100% similarity with Erwinia carotovora and the nucleotide sequence of ErAG1 (belonged to group 2) showed 100% similarity with Erwinia chrysanthemi. The results of this study will be the basis for further researchs to contribute to finding the effective methods to control bacterial soft rot disease on Taro.

Tóm tắt

Nghiên cứu được thực hiện tại Bộ môn Bảo vệ thực vật, Trường Đại học Cần Thơ. Mục tiêu của nghiên cứu nhằm xác định đến loài tác nhân vi khuẩn gây bệnh thối nhũn trên khoai môn ở đồng bằng sông Cửu Long. Trong nghiên cứu này, các dòng vi khuẩn được xác định dựa vào đặc điểm hình thái, đặc tính sinh hóa và triệu chứng bệnh. Kết quả cho thấy cả 8 dòng vi khuẩn phân lập đều thuộc chi Erwinia và được chia thành 2 nhóm: nhóm 1 gồm 4 dòng (ErĐT2, ErĐT3, ErĐT4 và ErĐT5) với các đặc điểm có thể thuộc loài Erwinia carotovora và nhóm 2 gồm 4 dòng (ErAG1, ErAG2, ErĐT1 và ErĐT6) với các đặc điểm có thể thuộc loài Erwinia chrysanthemi. Cả 8 dòng vi khuẩn thí nghiệm đều có khả năng gây bệnh trên khoai môn với triệu chứng điển hình của bệnh thối nhũn. Trình tự đoạn gene 16S rDNA của các dòng vi khuẩn thí nghiệm cũng đã được xác định và so sánh với trình tự gene vùng 16S rDNA của các mẫu sẵn có trên ngân hàng gene. Kết quả cho thấy, dòng vi khuẩn ErĐT4, đại điện cho 4 dòng vi khuẩn thuộc nhóm 1, có mức độ tương đồng với loài Erwinia carotovora là 100% và dòng vi khuẩn ErAG1, đại diện cho 4 dòng vi khuẩn thuộc nhóm 2, có mức độ tương đồng với loài Erwinia chrysanthemi là 100%. Kết quả của nghiên cứu này làm cơ sở cho những nghiên cứu tiếp theo nhằm góp phần tìm ra biện pháp phòng trị bệnh thối nhũn trên khoai môn một cách có hiệu quả.