ĐA DẠNG DI TRUYỀN NGUỒN GEN SÂM CAU (Curculigo orchioides Gaertn) BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ ISSR

Abstract

In the present study, genetic diversity of germplasm of Curculigo orchioides Gaertn was evaluated using ISSR marker. Total of 21 germplasms collected from 15 provinces, cities in Vietnam. Ten primers were used in the PCR reactions, producing 92 bands, sizing 150 bp – 1300 bp. An average of 9.2 bands/primer was obtained. The rate of polymorphic band was 80.4%. The coefficient of genetic similarity between 21 germplams ranged from 0.34 to 0.78. PIC index was ranged from 0.26-0.83, an average of 0.41. The genetic relationships among the 21 germplasms were divided into two groups: The first group includes SC1, SC6, SC5, CS2, SC8, SC9, SC10, SC3, SC7, SC4, SC11, SC12; The second group includes SC13, SC16, SC14, SC15, SC20, SC21, SC17, SC18, SC19. 

Tóm tắt

Trong nghiên cứu này, đa dạng di truyền trong số 21 nguồn gen sâm cau (Curculigo orchioides Gaertn) thu thập từ 15 tỉnh, thành trong nước đã được đánh giá bằng chỉ thị phân tử ISSR. Tổng cộng 92 băng DNA được tạo ra bằng khuếch đại 10 mồi, kích thước dao động từ 150 bp - 1300 bp, trung bình tạo ra 9,2 băng/mồi. Số băng đa hình chiếm 80,4%. Hệ số tương đồng di truyền trong số  21 nguồn gen dao động từ 0,34-0,78. Chỉ số PIC trung bình là 0,41. Chỉ số sai khác giữa các mồi là 9,96. Quan hệ di truyền trong số 21 nguồn gen được chia làm 2 nhóm lớn: Nhóm thứ nhất gồm các mẫu SC1, SC6, SC5, CS2, SC8, SC9, SC10, SC3, SC7, SC4, SC11, SC12; nhóm thứ 2 gồm các mẫu SC13, SC16, SC14, SC15, SC20, SC21, SC17, SC18, SC19.