NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG ỚT ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM BẰNG CHỊ THỈ SSR

Abstract

20 SSR markers were used to study genetic diversity of 90 local chilli varieties in Vietnam. The results revealed that the total number of alleles detected in 20 loci was 83 with an average of 4 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC) values varied from 0.4 to 0.8 with an average of 0.6 and genetic similarity coefficients ranged from 0.65 to 0.94. At a genetic similarity coefficient of 0.65, chilli varieties were divided into two groups: group I consisted of 80 chili varieties with genetic similarity coefficients ranged from 0.74 to 0.93; group II consisted of 10 chili varieties with genetic similarity coefficients ranged from 0.687 to 0.92. The research revealed 2 loci have unique alleles consisted of CAMS091 and CAMS-90. Thus, the results are valuable information for chilli conservation and breeding program in Vietnam.

Tóm tắt

20 chỉ thị SSR đã được sử dụng để nghiên cứu đa dạng di truyền của 90 mẫu giống ớt địa phương của Việt Nam. Kết quả cho thấy, tổng số alen phát hiện tại 20 locut là 83 alen khác nhau, trung bình 4 alen/locut. Hệ số thông tin đa hình của mồi (PIC) dao động từ 0,4 đến 0,8, trung bình 0,6 và mức độ tương đồng di truyền trong khoảng từ 0,65 đến 0,94. Tại mức tương đồng di truyền 0,65, các giống ớt nghiên cứu chia làm 2 nhóm: nhóm I gồm 80 mẫu giống có mức tương đồng di truyền từ 0,74 đến 0,93; nhóm II gồm 10 mẫu giống có mức tương đồng di truyền từ 0,687 đến 0,92. Nghiên cứu đã xác định được 2 chỉ thị cho nhận dạng đặc trưng là CAMS091 và CAMS-90. Các kết quả thu được trong nghiên cứu này rất có ý nghĩa trong công tác bảo tồn và chọn tạo giống ớt ở Việt Nam.