NGHIÊN CỨU SỬ DỤNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ ISSR (INTER-SIMPLE SEQUENCE REPEAT) ĐỂ ĐÁNH GIÁ SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA CÂY CHÔM CHÔM (Nephelium lappaceum L.)

Abstract

Rambutan (Nephelium lappaceum L.) is a tropical fruit tree with a delicious taste, rich in vitamins and minerals. In this study, 3 primers ISSR 03, ISSR 22 and ISSR 31 were used to evaluate the genetic diversity of 15 samples of 4 rambutan varieties. The electrophoresis results showed that primer ISSR 03 had 7 polymorphic bands (accounting for 77.7%) out of 9 amplified bands; primer ISSR 22 has 4 polymorphic bands, accounting for 50% of the total amplified bands and ISSR 31 has 5 polymorphic bands (71.42%) out of 7 amplified bands. In total, the polymorphism analysis showed 16 polymorphic bands, accounting for 66.6% of amplified bands. The results of UPGMA analysis with 3 ISSR markers showed high genetic similarity among rambutan samples, ranging from 0.75 to 0.96. The combined analysis of all 3 markers ISSR 03, ISSR 22 and ISSR 31 can help distinguish samples of different rambutan varieties in the study. The results of this study contribute to confirming the potential of the ISSR markers in investigating genetic relatedness, genetic diversity of plant populations, and rambutan cultivars in Vietnam.

Tóm tắt

Cây chôm chôm (Nephelium lappaceum L.) là loại cây ăn quả nhiệt đới có hương vị thơm ngon, giàu vitamin và khoáng chất. Nghiên cứu này đã sử dụng 3 mồi ISSR 03, ISSR 22 và ISSR 31 để đánh giá sự đa dạng di truyền của 15 mẫu giống chôm chôm. Kết quả điện di cho thấy, mồi ISSR 03 có 7 băng đa hình (chiếm 77,7%) trên 9 băng được khuếch đại; mồi ISSR 22 có 4 băng đa hình, chiếm 50% tổng số băng được khuếch đại và mồi ISSR 31 có 5 băng đa hình (chiếm 71,42%) trên tổng 7 băng được khuếch đại. Tổng hợp kết quả phân tích đa hình đã thu được 24 băng ADN được khuếch đại, trong đó có 16 băng đa hình, chiếm 66,6% tổng số băng khuếch đại. Kết quả xây dựng giản đồ phân nhánh UPGMA với 3 chỉ thị ISSR cho thấy, mức độ tương đồng của các mẫu dao động trong phạm vi 0,75 - 0,96, cho thấy sự tương đồng di truyền khá cao giữa các mẫu giống nghiên cứu. Phân tích kết hợp cả 3 chỉ thị ISSR 03, ISSR 22 và ISSR 31 có thể giúp phân biệt được các mẫu giống chôm chôm trong nghiên cứu. Kết quả của nghiên cứu này góp phần khẳng định thêm ý nghĩa của chỉ thị ISSR trong nghiên cứu đa dạng di truyền, nhận biết giống cây trồng nói chung và cây chôm chôm nói riêng tại Việt Nam.